| 学校法人皇學館 | |||
| 皇學館大学 | |||
| 大学院 | 文学研究科 | 博士前期課程 博士後期課程 |
神道学専攻 国文学専攻 国史学専攻 |
| 修士課程 | 教育学専攻 | ||
| 社会福祉学研究科 | 修士課程 | 社会福祉学専攻 | |
| 専攻科 | 神道学専攻科 | 神道学専攻 | |
| 文学部 |
神道学科 国文学科 国史学科 コミュニケーション学科 |
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| 教育学部 | 教育学科 |
学校教育コース 幼児教育コース スポーツ健康科学コース 特別支援教育コース |
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| 現代日本社会学部 | 現代日本社会学科 |
政治・経済分野 現代社会分野 福祉計画・社会福祉分野 伝統・文化分野 |
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| 社会福祉学部 （平成22年4月より現代日本社会学部に改組） | 社会福祉学科 |
社会福祉学専攻 こども福祉学専攻 |
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| 附置研究所 | 地域福祉文化研究所 | ||
| 附属図書館 | |||
| 情報処理センター | |||
| 教育開発センター | 学習支援室 | ||
| 学生支援センター | |||
| 附置研究所 | 神道研究所 史料編纂所 |
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| 佐川記念神道博物館 | |||
| 皇學館高等学校 | |||
| 普通科 | |||
| 皇學館中学校 | |||
| 監査室 法人本部 |
館史編纂室 | |
| 出版部 | ||
| 法人本部事務局 | 総務部（総務・人事・情報・記念事業・教学振興各担当） | |
| 財務部（会計・管財各担当） | ||
| 企画部（企画・広報各担当） | ||
| 皇學館大学事務局 | 総務部（総務・情報各担当） | |
| 財務部（会計・管財各担当） | ||
| 企画部（企画・広報各担当） | ||
| 神職養成部（神職養成担当） | ||
| 学生支援部（入試・教務・学生・就職・教職支援・実習支援室各担当） | ||
| 附属図書館 | 附属図書館事務部 | 附属図書館事務室 |
| 情報処理センター | 事務室 | |
| 教育開発センター | 事務室 | |
| 附置研究所 | 神道研究所事務室 | |
| 史料編纂所事務室 | ||
| 佐川記念神道博物館 | 事務室 | |
| 高等学校・中学校 | 学校事務部 | 学校事務室 |
